Baikal.Hack

pf@kruzhok.org

Baikal.
Hack

Online, 19−20 декабря 2020 года

хакатон по биоинформатике для 9−11 классов

Мероприятие завершено

Итоги

172 участника

На хакатон зарегистрировалось 172 участника

13 команд

До финала дошли 13 команд

1 место

разделили команды «Иридоциклиит» (Михаил Акулинин, Анна Кузнецова, Никита Тумаков) и «Семья вады» (Евникия Кадочникова, Галина Мягкова, Вероника Помошникова)

2 место

«Бион» (Мария Михайлова, Анастасия Строева) и «Ура ура» (Мария Новикова, Софья Трофимова, Дарья Шинкарева)

3 место

команды «Boy next gene» (Ярослав Деменчук, Вера Туртапкина, Георгий Мингалев) и «Лопух большой» (Анастасия Романова, Арина Симонова, Юлия Футько)

О чeм хакатон?

Как работает эволюция и как образовываются новые виды? Тема эта интересная, но учёным в ней многое пока неясно. Возможно, в ближайшие годы именно биоинформатикам удастся сделать много открытий в этой области.

Байкал славится своими эндемиками: в нем очень много специфичных видов с разными и интересными эволюционными историями. Сотни видов байкальских бокоплавов уже стали основой нескольких научных статей, а вот история 30 видов керчаковых рыб — бычков — пока остается неизвестной.

Задача

Проанализировать гены бычков биоинформатическими методами и сформулировать гипотезы об эволюционной истории генов и видов. Результаты нужно будет представить в формате научной статьи.

Что нужно для участия?

учиться в 9−11 классах школы. *

Необходимо и достаточно:

интересоваться молекулярной биологией и теорией эволюции на школьном уровне

* более младшим участникам будет трудно, а старшие могут участвовать вне конкурса

собрать команду из 3−4 человек или быть готовым работать в команде с другими участниками

Расписание хакатона

(время московское)

19 декабря 2020

20 декабря 2020

10.00 Открытие, постановка задачи, материалы

10.00 Мастер-класс по филогенетическим деревьям

11.00 Мастер-класс по базе данных ncbi и форматам генетических данных

11.00-14.00 Самостоятельная работа

14.00-15.00 Консультация с ментором

16.00 Сдача статей

18.00 Подведение итогов

12.00-18.00 Самостоятельная работа

18.00−20.00 Презентация предварительных материалов ментору

Что у вас будет

3 вида глубоководных бычков
3 вида обычных бычков
Неаннотированные последовательности из их транскриптомов, собранных в 2020 году
Описания биоинформатических методов, которые вам могут понадобиться

Что почитать, посмотреть и изучить перед хакатоном

ДНК, трансляция, транскрипция, мутация, нуклеотид, рамка считывания, триплет, старт-кодон, синонимичные и несинонимичные замены, секвенирование, геном, вид, симпатрическое видообразование

Первые 2 раздела курса доступным языком рассказывают, как устроена генетическая информация

- работа с базами данных последовательностей ДНК
- аннотация генов
- выравнивание последовательностей
- построение филогенетических деревьев
- визуализация 3D структуры белков

— познакомятся с биоинформатическими методами:

— опыт написания научных статей
— классный исследовательский проект в малоизученной и передовой области
— участие в хакатоне учитывается в конкурсе «Талант», победители которого получают до 10 баллов ЕГЭ

Что получат участники хакатона?

Организаторы

За предоставленные данные благодарим лабораторию молекулярной генетики ВНИРО и Байкальский Музей